Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Cops6O88545 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops6O88545 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cops6O88545 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cops6O88545 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops6O88545 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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