Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Stra6O70491 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Stra6O70491 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Stra6O70491 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Stra6O70491 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Stra6O70491 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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