Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a2O54833 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms