Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DffaO54786 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DffaO54786 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DffaO54786 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DffaO54786 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DffaO54786 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DffaO54786 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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DffaO54786 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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DffaO54786 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DffaO54786 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DffaO54786 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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