Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CrxO54751 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CrxO54751 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CrxO54751 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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