Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clk2O35491 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk2O35491 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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