Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Slc27a2O35488 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Slc27a2O35488 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Slc27a2O35488 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Slc27a2O35488 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Slc27a2O35488 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Slc27a2O35488 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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