Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna3O35344 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms