Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms