Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms