Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MttpO08601 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MttpO08601 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms