Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms