Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms