Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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