Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3415J3QMS8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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