Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn34c3J3QJW5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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