Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp72F8VQC1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms