Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms