Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h7bF8VPP8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h7bF8VPP8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms