Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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H2-M1F7CXU4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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H2-M1F7CXU4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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H2-M1F7CXU4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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H2-M1F7CXU4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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H2-M1F7CXU4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-M1F7CXU4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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