Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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