Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms