Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Urb2E9Q7L1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb2E9Q7L1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms