Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brd1E9PZ26 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms