Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms