Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rfx8D3YU81 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rfx8D3YU81 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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