Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce3B5KM66 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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