Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms