Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms