Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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