Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms