Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms