Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a6B1AVK5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a6B1AVK5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a6B1AVK5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a6B1AVK5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a6B1AVK5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a6B1AVK5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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