Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Trabd2bB1ATG9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Trabd2bB1ATG9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trabd2bB1ATG9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms