Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms