Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Grik3B1AS29 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Grik3B1AS29 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms