Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms