Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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