Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms