Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc183A2AJB1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc183A2AJB1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc183A2AJB1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms