Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms