Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a3A2ACT7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms