Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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