Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vstm4T1NXB5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vstm4T1NXB5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vstm4T1NXB5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vstm4T1NXB5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vstm4T1NXB5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vstm4T1NXB5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vstm4T1NXB5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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