Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms