Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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