Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms