Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne6Q9Z140 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne6Q9Z140 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms