Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms