Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec2Q9WV35 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms